Los orígenes de San Javier se remontan a la Reducción Jesuítica de Francisco Javier, fundada el 3 de diciembre de 1629 por el padre José Ordoñez, miembro de la Compañía de Jesús. Esta reducción formó parte del proyecto misional jesuítico, que tuvo una profunda influencia en la región durante el siglo XVII.
Lo que hoy conocemos como San Javier fue fruto de una refundación el 2 de octubre de 1877, más de un siglo después de la expulsión de los jesuitas en 1767. Esta nueva etapa consolidó el desarrollo de la localidad como parte del crecimiento de la provincia de Misiones.
Bordeada por el río Uruguay, San Javier es una de las localidades destacadas en la producción de caña de azúcar, actividad que ha sido un pilar de su economía durante décadas y le ha valido el apodo de “la dulce”.
Ubicada a 69 kilómetros de Oberá y a 130 kilómetros de Posadas, constituye además un importante paso fronterizo que conecta a la provincia de Misiones con Brasil a través del río Uruguay, reforzando su rol estratégico en el intercambio comercial y cultural.
En las Elecciones Legislativas del 8 de junio de 2025 estuvieron habilitados para votar 11.811 electores nacionales, distribuidos en 34 mesas en 5 centros de votación.